Как послать из приложения команду в реестр, чтобы при следующем включении компьютера приложение запускалось самостоятельно.

Видать придется извращаться. Я знаю что можно кидать ярлычек программы в папку "автозапуск", и будет вселенское счастье. Можно скопировать этот ярлычек из одного места в эту папку "Автозапуск".
Вопрос в другом: как определить имя пользователя? Ибо без него не прописать путь до папки.

Ответ: Автозапуск приложения.
 

в реестр нужно писать. гугл подскажет ткуда конкретно

Ответ: Автозапуск приложения.
 

:wallbash: Я вообще-то спросил как послать команду, а не куда!

Ответ: Автозапуск приложения.
 

При включенном UAC могут возникнуть проблемы при записи в реестр.
Юзайте планировщик заданий:
http://www.cyberforum.ru/delphi/thread526938.html