[Samodelkin]

Преломления и отражения -- разные вещи. Преломление лучей искажает изображение под водой, а отражение формирует изображение объектов над водой. В данной ситуации, видимо, геометрия воды при такой высоте волн не может создавать углы отражения при которых формируется данное изображение. Если шейдер позволяет настраивать высоту волн, для начала надо посмотреть какое отражение будет при отсутствии волн, возможно с ним уже что-то не так, а затем постепенно увеличивать рябь и смотреть, будут ли в соответствующих пропорциях искажаться отражения.