Точно, можно же найти первый подсемпл и потом стандартным алгоритмом его прогнать и найти все вхождения , что-то затупил
А можно, я так подумал, АКФ расчитать и в пиках функции буду совпадения.
http://ru.m.wikipedia.org/wiki/%D0%9...%D0%B8%D1%8 F
Эта штука хороша для аудиоигр, что бы не только в зависимости от спектра была игра