md2 использует морфную анимацию, то есть повертексную, а не костную. b3d формат выдерживает только до 256 вершин в одной модели, чтоб использовать морфную анимацию, так как на каждую вершину создается по кости
. 3ds вообще не держит ни костной, ни морфной анимации, так что остается X формат.