Все. Решил.
Кому так приспичит, то делйте как Mr_F_ говорит, но с несколькими правками:
- У шейдера, который должен быть прозрачным нужно ZWrite Off
- Render Queue у Z-шейдера и Прозрачности = 3000.
Если not 1, то частично сортировка будет неправильной и видны будут некоторые грани.
Если not 2, то будет артефакты на мобилах.
Если не делать финт с Z-буффером, то будет полностью неправильная сортировка.