А в исходниках посмотреть? (intellij idea позволяет с goto declaration в пару кликов их открывать).
UPD: в классе Texture есть
final static Map<Application, Array<Texture>> managedTextures
- списочек загруженных текстур.
Модификатора доступа нет - чтобы добраться до него, надо будет унаследоваться от Texture или забить на этот способ.
Флагов не заметно, по дефолту в переменные присваивается Nearest.
Имхо, проще написать какой-нибудь метод в стиле Texture loadTexture(String name), который будет грузить текстуру и ставить нужные параметры фильтрации, генерировать mipMaps и делать прочие вещи.