Старано переведи сначала на последнюю версию Unity 5. Скачать ее можно на сайте в Unity archive (вбей в google). А уже после на 2017 и далее. В любом случае несколько версий Unity потребуется. Перфабы вроде теряться не должны. Глюки при компиляции новые должны появиться. С текстурами могут быть проблемы так как в Unity 5.5 изменилась энумерация типов текстур:
До:
https://docs.unity3d.com/540/Documen...orterType.html
И после:
https://docs.unity3d.com/550/Documen...orterType.html
Кроме того убрали TextureImporter.textureFormat
https://docs.unity3d.com/550/Documen...ureFormat.html
а вместо него появился TextureImporter.textureCompression
https://docs.unity3d.com/550/Documen...mpression.html
это меняет многие настройки текстур они могут быть отмечены как поврежденные. Возможно их нужно вручную перенастроить или сделать дополнительный reimport.