Ответ: Один главный скрипт или модульность?
 

В C# нет инклудов. Есть только partial.

Ответ: Один главный скрипт или модульность?
 

А как же using?

Ответ: Один главный скрипт или модульность?
 

using namespace? пространство имен и инклуды абсолютно разные вещи.
юсин лишь позволяет не писать путь к пространству имен в коде.
п.с. импорты в джаве лучше ибо они автоматически ставятся. в шарпе я еще ниразу не видел чтобы кто-то писал свое пространство имен. да и в одно пространство имен обычно столько классов засовывают, что список из сотни абсолютно разных классов получатся. и я так понимаю я свой класс вполне могу засунуть в чужое пространство имен, что не гуд. да и весь код в фигурные скобки брать - мне не нравится.

Ответ: Один главный скрипт или модульность?
 

просто using.

хотя да. это просто неймспейсы.

в любом случае можно писать классы в разных cs файлах и пользоваться общими функциями даже без using ( по крайней мере в MSVS, не знаю как на юнити)

Ответ: Один главный скрипт или модульность?
 

С точки зрения игрока не важно, как написана игра, поэтому, я считаю, нужно делать так, как удобно, даже если сам инструмент настроен именно на работу с отдельными скриптами, объектами и префабами.

Ответ: Один главный скрипт или модульность?
 

Эм... Посоны. Можно подробней про юзанье одного главного скрипта и контроль объектов* из него? Просто хочу понять как работать с этим.
* - в смысле, какой самый шустрый вариант.

Ответ: Один главный скрипт или модульность?
 

По скорости работы скриптов варианты одинаковые, по организации кода и модульности разработки главный скрипт проигрывает по всем пунктам. Никакого конструктора игр одним главным скриптом из Unity не сделать, а ведь конструктор - это ее достоинство.