Я бы визуализировал полностью на волуметрическом рендере используя шейдеры.
Ограничение по минимальной видеокарте - требуется хорошее железо.
Но зато очень качественная будет картинка.
Массив по сути нужно будет загонять в 3д текстуру, что будет требовать весьма много.
Хотя зависит как реалезуешь
Вот пару картинок примеров волуметрического рендеринга:
http://www.coin3d.org/usage/casestud...etryvolume.jpg
http://graphics.stanford.edu/papers/shear/colorhead.jpg
А вот ещё интерестная ссылочка о воксельном скульптуринге:
http://www.3d-coat.com/v3_voxel_sculpting.html