А вот у меня когда-то (года три назад) сгорел южный мост на материнке из-за встроенного дерьмового USB контроллера
Пришлось тогда материнку новую покупать.
В данном случае может помочь PCI контроллер USB, если и вправду на материнке сгорел контроллер. А флешки могут загораться от питания порта, а не от работоспособности контроллера.
И кстати пробовал не обновлять а удалять устройства USB из диспетчера устройств?