Если скрипт находиться на игроке, то:
transform.GetComponent("FPSInputController").enabled = false;
Если на другом объекте:
var player = (тут ищем либо по тегу)
player.GetComponent("FPSInputController").enabled = false;
или:
public player : Transform; // сюда кладем игрока
player.GetComponent("FPSInputController").enabled = false;
или:
public player_script : FPSInputController; // сюда кладем игрока
player_script.enabled = false;