Берешь MilkShape и либо с помощью tools\half-life\decompile...
либо с помощью tools\kratisto's half-life mdl decompiler
декомпилишь .mdl файлы моделей из КС. Получаешь в результате текстуры в bmp, файлы анимаций название_анимации.smd, файл меша со скелетом он обычно больше всех весит и имеет в названии сокращение ref или название модели, тоже .smd. Так же получаешь файл с расширение .qc в котором написан скрипт загрузки модели, он тебе ненужен
Импортируешь в MilkShape .smd файл меша со скелетом, потом импортируешь файл анимации точно также и сохраняешь в b3d.