У меня такого не было, но инет говорит следующее.
OnGUI за кадр вызывается несколько раз. Если используется Layout, то сначала с событием Event.layout, затем с событиями типа mouseDown. В конце с событием repaint. Если внутри OnGUI используются некие переменные, управляемые извне и вывод GUI зависит от этих переменных, то Юнити боится, что может возникнуть ошибка вывода и выдает сама такую ошибку.
Кода Вашего нет, так что придется разбираться Вам самому - верно это или нет.