Можно экспортировать сцены книжек в бандли и скачивать в приложение библиотеку. Вероятно надо для каждой книги свои имена сцен... (вот только не помню что на счет кода) Вероятно все сцены должны работать с одним набором кода и быть в одном проекте...
http://docs.unity3d.com/Documentatio...setBundle.html