Для нативных под андроид - Android SDK или IntelliJ Idea (разницы между ними почти нет, первая основана на второй, но год назад казалась сыроватой). Субьективно, eclipse лучше не пробовать - показалась неудобной и тормозной. Хотя раньше она активно использовалась и по инерции можно найти кучу статей, где пишут на ней.
Ещё есть NDK, чтобы писать на Си++, но по нему меньше информации в интернете
P.S. Написанные на java приложеньки при запуске форкают процесс с уже запущенной Dalvik VM, поэтому загрузка мгновенная, а приложение на Unity порядка секунды загружает свою виртуальную машинку. Для игр не критично, а для приложений типа "календарь" может немного бесить.