Никогда не использовал prefork, c worker`ом все нормально работает. Возможно виснут коннекты, и постепенно забиваются до максимума, KeepAlive может глючит. Посмотри процессы в моменты когда тормозит и когда нормально работает.
Nginx поставить тоже хорошо бы перед апачем.
Если сама игра не на php работает, то использовать apache+php+mysql просто для связи игры и базы - тот еще изврат
. Сделали бы что-нибудь самописное - и то лучше бы было.
Что хоть за игра то? Интересно же.